九巴在環保領域上再創潮流，率先引進歐盟第五代環保引擎，並將該款引擎安裝於一部巴士上進行測試，成為全亞洲首部配備歐盟第五代環保引擎的雙層巴士。歐盟第五代環保引擎能大幅減少氮氧化物的排放，使排放質素達到世界上最嚴格的標準，有助締造更清新的環境。

九巴首席機械工程師沈乙紅先生表示：「九巴一直與巴士供應商及引擎製造商建立穩健的伙伴合作關係，不斷將最新的科技引進香港。今次引入歐盟第五代環保引擎，可讓維修人員先行瞭解這款引擎在維修保養方面所需的配合，同時測試這款引擎在不同路面環境下對巴士的驅動力、耗油量及廢氣排放等方面的影響及表現，為九巴日後引進歐盟第五代環保巴士做好準備。該部安裝了歐盟第五代環保引擎的雙層巴士原行走來往天水圍鐵路站與落馬洲支線的B1線，稍後將安排行走市區及郊區路線，方便評估歐盟第五代巴士各方面的表現。」

與歐盟第四代引擎比較，歐盟第五代環保引擎在氮氧化物的排放方面有顯著改善。以每小時千瓦計算，氮氧化物的排放減少百分之四十三，由三點五克減至兩克；而懸浮粒子、一氧化碳及碳氫化物的排放則維持不變，即分別為零點零二克、一點五克及零點四六克。由於氮氧化物的積聚會形成光化煙霧 (photochemical smog)，而光化煙霧會刺激人體的呼吸系統，影響健康，故減低氮氧化物的排放十分重要。

歐盟第五代環保引擎採用還原催化技術，引擎裝配了還原催化器，利用注入濃度達32.5%的氨素溶液，使其釋出的氨與引擎排出的氮氧化物產生化學還原作用，把氮氧化物還原為不影響自然環境的氮氣及水蒸氣。為進一步減低氮氧化物的排放，歐盟第五代環保引擎增加氨素溶液的注入量，由歐盟第四代引擎約百分之四點五增至大約百分之五點五。

此外，歐盟第五代環保引擎亦添置新一代的監察系統 (On-Board Diagnostics Stage II)，安裝於車輛的排氣喉，以監察車輛的氮氧化物排放是否達到歐盟第五代的標準，方便監察引擎的表現，並在需要時更快作出修正。

截至二零零九年一月，九巴環保巴士車隊共有3,933部巴士，全部符合歐洲環保部長委員會嚴格的廢氣排放標準。九巴目前擁有1部配備歐盟第五代環保引擎的巴士，3部配備歐盟第四代引擎的巴士，另有752部配備歐盟第二代及歐盟第三代引擎的巴士已安裝了減排裝置，使其懸浮粒子排放水平提升至十分接近歐盟第四代引擎的有關標準。達到歐盟第三代排放水平的九巴則有445部。此外，透過在較早期的巴士上全面加裝柴油催化轉換器及使用超低硫柴油，車隊中的歐盟第一代及更早期巴士的微粒排放標準分別提升至歐盟第二代及歐盟第一代的水平。目前，車隊中有2,331部達到歐盟第二代排放水平的巴士，達到歐盟第一代排放水平的巴士則有401部。目前，九巴正為1,600多部歐盟第二代及第三代巴士加裝微粒過濾器，使其懸浮粒子的排放水平能大幅提高至歐盟第四代及第五代的水平，是項工程預計於2010年內完成。